查找具有特定名称的文件夹，并在每位位置上运行bash命令
bashcommand-line
查找具有特定名称的文件夹，并在每位位置上运行bash命令,bash,command-line,Bash,CommandLine,我有多个Freesurfer导入，每位导入中都有名为“stats”的子目录。我想运行一个bash脚本，搜索每位“stats”文件夹，之后将其倒入其中，运行一个预定义的perl脚本linux下载，转换每位文件夹中包含的指定stats文件。我希望它们在每位文件夹上递归运行。统计文件夹的名称是MRI编号linux查找文件夹命令，之后是日期我还能从其中一个导入的子文件夹中获取脚本来分离MRIDATE、MIRIID和创建文件。我没法让它在下边的子目录中工作#!/bin/bashDIR=”$(cd”$(dirname”${BASH
我有多个Freesurfer导入，每位导入中都有名为“stats”的子目录。我想运行一个bash脚本，搜索每位“stats”文件夹linux是什么系统，之后将其倒入其中，运行一个预定义的perl脚本，转换每位文件夹中包含的指定stats文件。我希望它们在每位文件夹上递归运行。统计文件夹的名称是MRI编号linux查找文件夹命令，之后是日期
我还能从其中一个导入的子文件夹中获取脚本来分离MRIDATE、MIRIID和创建文件。我没法让它在下边的子目录中工作
#!/bin/bash
DIR="$( cd "$( dirname "${BASH_SOURCE[0]}" )" >/dev/null 2>&1 && pwd )"
for D in */*/*/stats/; do
echo $D
if [ -d "${D}" ]; then
cd "${D}"
cwd=$(pwd)
D2=$(dirname "$cwd")
#Capture second folder in MRI name and date
MRINAME=$(basename "$D2")
DIRNAME2=$(basename "$D2")/$(basename "$cwd")
MRIID="$(cut -d'_' -f1 <<<"$MRINAME")"
echo "$MRIID"
MRIDATE="$(cut -d'_' -f2 <<<"$MRINAME")"
echo "$MRIDATE"
/Users/xxxxx/Documents/Bitbucket Repository/conversion-scripts/mri-read.pl -d $MRIDATE -s $MRIID lh.aparc.stats rh.aparc.stats wmparc.stats aseg.stats
fi
done
#/bin/bash
DIR=“$（cd“$（dirname“${BASH_SOURCE[0]}”）”>/dev/null 2>&1&&pwd）
适用于*/*/*/stats/中的D；做
echo$D
如果[-d“${d}”]；然后
cd“${D}”
cwd=$（pwd）
D2=$（目录名“$cwd”）
#捕获MRI名称和日期中的第二个文件夹
MRINAME=$（basename“$D2”）
DIRNAME2=$（basename“$D2”）/$（basename“$cwd”）
MRIID=“$（cut-d'-f1我更正了第一个问题中的代码。它工作得非常好
#!/bin/bash
DIR="$( cd "$( dirname "${BASH_SOURCE[0]}" )" >/dev/null 2>&1 && pwd )"
for D in */*/*/stats/; do
echo $D
if [ -d "${D}" ]; then
cd "${D}"
cwd=$(pwd)
D2=$(dirname "$cwd")
#Capture second folder in MRI name and date
MRINAME=$(basename "$D2")
DIRNAME2=$(basename "$D2")/$(basename "$cwd")
MRIID="$(cut -d'_' -f1 <<<"$MRINAME")"
echo "$MRIID"
MRIDATE="$(cut -d'_' -f2 <<<"$MRINAME")"
echo "$MRIDATE"
"$DIR/mri-read.pl" -d $MRIDATE -s $MRIID lh.aparc.stats rh.aparc.stats wmparc.stats aseg.stats
cd "${DIR}"
fi
done
！/bin/bash
DIR=“$（cd“$（dirname“${BASH_SOURCE[0]}”）”>/dev/null 2>&1&&pwd）
对于*/*/*/stats/；do中的D
echo$D
如果[-d“${d}”]；则
cd“${D}”
cwd=$（pwd）
D2=$（目录名“$cwd”）
#捕获MRI名称和日期中的第二个文件夹
MRINAME=$（basename“$D2”）
DIRNAME2=$（basename“$D2”）/$（basename“$cwd”）
MRIID=“$（cut-d'-f1您需要将光盘放回if块末尾的父目录。您可以使用cd
in/
cd
out或
pushd
/
popd
或将块的内部（在
then
和
fi
之间）包装到子shell（parens）中
比如：
for dir in */
do
# the if [ -d ... isn't necessary since the filespec in the for ends with a slash
pushd "$dir" > /dev/null
# other stuff
popd > /dev/null
done
IFS=read-rMRIIDMRIDATE我做了一些更改。我可以在找到的第一个文件夹上运行命令，但不能在第二个文件夹上运行，或则在第二个文件夹上运行更多。您须要
cd
返回
if
块末尾的父目录。您可以使用
cd
in/
cd
out或
pushdir
/
popdir
或将块的内部（在
然后
和
fi
之间）包装在子shell（parens）中。倘若这解决了您的整个问题，请告诉我，我会将此注释的内容作为答案发布。为何我没有听到？这特别有效。不要将所有小写字母用于非导入变量。请参阅
